陳文輝教授現在任職國立成功大學蘭花研發中心顧問,成大生命科學系及熱帶植物研究所兼任教授,國立高雄大學生命科學系榮譽教授,台灣蘭花產銷發展協會技術諮詢顧問,台灣蘭花育種者協會學術顧問。

1988年開始從事蝴蝶蘭品種改良新技術開發工作，並擔任台糖研究所園藝系主任，育成139個新品種在英國皇家園藝學會以Taisuco命名登錄，建立台糖蝴蝶蘭國際品牌。育成之台糖蝴蝶蘭品種曾參加多次國內外國際性花展或蘭展，分別獲得116項大獎，如領隊參加1993年英國第十四屆世界蘭花會議及蘭展，計有10個品種獲得13面獎牌，其中台糖大白花品種Phal. Taisuco Kaaladian ‘TSC27’獲得大會銀牌獎、分組冠軍獎、優良品種第一獎及大白花分組第一獎。發表28篇有關台糖蝴蝶蘭等花卉育種技術、栽培技術之論文。

1990年在成大生物系兼任副教授，1994年擔任國際植物組織培養協會台灣分會會長，蝴蝶蘭之研究成果曾於1992年獲行政院〔傑出研究獎〕乙等獎。

2003年9月離開台糖公司，到國立高雄大學擔任生命科學系教授兼系主任及生物科技研究所所長。2003-2020年，又有62學術論文分別發表刊登於國際著名學術刊物，並於2007,2011,2017及2021年分別編著乙冊國際性英文專書：蘭花生物科技( Orchid Biotechnology and Orchid Biotechnology II, III,IV )。因此，於2007年榮獲美國蘭藝協會(AOS)院士(fellow)榮譽。2008年獲聘為國立高雄大學特聘教授。 2011年獲聘為國立高雄大學榮譽教授及榮獲中華植物學會終身貢獻獎。於2011年受邀在新加坡第20屆世界蘭花會議擔任主題演講及分組主持人, 並榮獲東南亞蘭藝協會(OSSEA)院士榮譽，及中華植物學會終身成就獎。2014榮獲國立臺灣師範大學第14屆傑出校友，2016年榮獲國際蝴蝶蘭聯盟(IPA) 傑出貢獻獎。